蛋白质组学名词解释，蛋白质组学质谱分析

蛋白质组学的研究手段有哪些？原来这里已经有回答了，还不满意，希望详尽点。

可有效的分析极酸或极碱。cICAT采用了13C和酸性可裂解生物素而克服了ICAT的部分缺点。DIGE有效地改善了传统2-DE的重复性。
四 定量蛋白质组学方法：
⑴ ICAT(isotope-coded affinity tags)方法。ICAT是用于定量蛋白质组学研究的稳定同位素标签法的一种一 双向电泳、会丢失转录后修饰信息、相同肽段由于标记上的差异在HPLC中会产生不一致的洗脱表现以及增加的生物素基团会增加质谱解析的复杂性[47][48]，经阳离子交换色谱和亲和素亲和纯化，然后进入质谱鉴定、高度疏水等传统2-DE方法难以分析的蛋白质。

⑶ iTRAQ 。iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)法可同时分析多达四个不同样品的。双向电泳(two-dimensional electrophoresis, 2-DE)与质谱(mass spectrum, MS)的结合是最常见的蛋白质组学的研究手段。

⑵ cICAT (cleavable isotope-coded affinity tags)。也是稳定同位素标签法，基于ICAT，带有生物素半分子的同位素标签对样品中蛋白质的半胱氨酸残基进行标记，标记的蛋白样品经过消化成为肽段后，而且易于实现分析的自动化。
三 荧光差异凝胶电泳技术(differential in-gel electrophoresis、反相HPLC(high-performance liquid chromatography)而被分离。该方法的中HPLC可以直接和质谱偶联。在稳定同位素标签法中，质谱可以通过识别标记的肽段和未标记的肽段之间的信号强度差异来达到定量的目的。在ICAT方法中, DIGE)。DIGE可用三种不同的荧光染料来分别对样品进行标记，荧光染料可以通过酰胺键与蛋白质的赖氨酸ε-氨基共价结合。将标记的样品混合然后在同一块双向电泳凝胶上分离。这样在一块双向电泳凝胶上可获得三幅图像，即在一块凝胶内分析不同的蛋白样品。相同肽段在质谱上会表现为双峰，峰的强度直接反应了该肽段对应的蛋白质在两种样品中的相对强度。ICAT的缺点是无法标记缺乏半胱氨酸残基的蛋白质。双向电泳包括第一向等电聚焦(Isoelectric focusing, IEF)和第二向SDS-PAGE(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis)。双向电泳可以提供包含有分子量和等电点信息的二维图谱
二 多维色谱法。在多维色谱法中，蛋白样品通常先被消化成肽段，然后经过离子交换

定量蛋白质组学技术里iTRAQ和TMT有什么区别

其实都是可以的,不过用的最多的都是ESI-itrap,很多trap联用。毕竟trap的效率没有TOF那么高

iTRAQ、SILAC和SWATH等相比，我更应该选择哪一种定量的方法呢？

目前主流的定量蛋白质组方法有5种，分别是iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法，该方法不依赖样本，可以做任意样本的总蛋白质的差异定量，而且定量准确，这个层次上label-free虽然也可以做任意样本，但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量，组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式，中途测试新组织难度较大，极易失败，细胞层次的SILAC培养费用高昂，不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式，但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量，准确度极高，通量远高于MRM，对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本，SWATH效果非常好，当然，SWATH价格相对较高。SWATH本身对物种没有偏向性，也是目标蛋白定量的一种，定量结果准确，可以和MRM媲美，发文章更具有说服力，但是一次能定量只能达到2000多个蛋白

itraq蛋白的fc值为什么选1.5以上

itraq定量蛋白质组技术服务因其标记效率高、灵敏度高、定量准确以及一次可以标记至多8个样品等特点，可以快速发现不同条件影响的蛋白质组的差异，并且锁定差异蛋白质进行功能研究。武汉金开瑞生物iTRAQ 定量蛋白质组技术服务仅需7000元/样。

iTRAQ是什么

多个（每组最多8个）来源不同的蛋白样品经过不同标签标记后，可以合并后同时进行质谱分析。在每个肽段二级质谱图上，相应每个样品的报告离子强度用以表征该蛋白在不同样品中相对含量的高低，而肽段碎片离子可用于蛋白的鉴定分析。是鉴定与定量同时进行的一种定量技术。

刚刚有人回答我的问题的时候推荐的 邦菲iTRAQ论坛 恩恩